Dica testada na distribuição Funtoo.

Para criar um pendrive bootável com o sistema Windows 7, usando o Linux, você vai precisar de:

• Imagem do Windows 7 (ou o DVD)
• Programa ms-sys no Linux
• Programa cfdisk no Linux
• Um pendrive com pelo menos 8 GB

Conecte o pendrive. Vamos supor que ele ficou em "/dev/sdb". Execute:

# cfdisk /dev/sdb

Usando essa ferramenta, apague todas as partições do pendrive e crie uma única partição (marcada como bootável e do tipo 7).

Assim será criado uma partição chamada "/dev/sdb1". Saia do cfdisk.

Formate a partição com:

# mkfs.ntfs -f /dev/sdb1

Grave o MBR do Windows 7 no pendrive (/dev/sdb e não /dev/sdb1):

# ms-sys -7 /dev/sdb

Monte a imagem ISO (ou o DVD) do Windows 7:

# mount -o loop win7.iso /mnt/iso

Ou:

# mount /dev/sr0 /mnt/iso

E monte a partição que está no pendrive:

# mount /dev/sdb1 /mnt/usb

Copie todos os arquivos do DVD ou da imagem ISO do Windows 7 para a partição do pendrive:

# cp -r /mnt/iso/* /mnt/usb/

Fim!

Agora pode dar boot pelo pendrive que irá iniciar o Windows 7.

Opcionalmente poderá salvar essa imagem para usar em outros pendrives sem precisar executar todo o procedimento de novo. Basta usar:

# dd if=/dev/sdb of=/home/win7.img

Assim será criado uma imagem do sistema, bootável, dentro de /home.

Para restaurar em outro pendrive, bastaria executar o contrário do comando anterior:

# dd if=/home/win7.img of=/dev/sdb

É isso!

Fonte:

• How to make Windows 7 USB flash install media from Linux? - Server Fault