Em caso de problemas na criação dos módulos, certifique-se que tem os headers do kernel instalado, pois do contrário, a instalação falhará. Alguns casos:

Arch Linux:

# pacman -S linux-headers

Debian-likes:

sudo apt-get install build-essential linux-headers-`uname -r`

Fedora:

# yum install kernel-headers-`uname -r`

Slackware:

# slackpkg install kernel-headers

* Em caso de atualização para um novo kernel, o instalador deverá ser executado novamente.

Obviamente, ficaram de fora algumas distribuições, pois citei apenas as que conheço. Para o caso das demais, procurem pelos pacotes equivalentes a:

• linux-headers;
• kernel-headers;
• kernel-devel, etc.

Novas versões do programa poderão ser baixadas no link abaixo, bastando adaptar os passos aqui descritos pelas novas versões:

• Linux_Downloads - Oracle VM VirtualBox

Referência:

• How-To :: instalação manual do VirtualBox no Linux | Mundo GNU