Associação de dados

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Felipe Lopes de Assis
felipelopesassis

(usa Ubuntu)

Enviado em 22/10/2015 - 14:33h

Boa tarde a todos!!

Estou com o seguinte problema: Tenho um arquivo .csv com resultado de Blast

Ex:
gi_109287882_ref_YP_654576_1__hypothetical_protein_MIV004R_[Invertebrate_iridescent_virus_3] 237 439 451 BrMar_R274 175 375 389 5E-020 85.5 216 32.41 70 118
gi_109287887_ref_YP_654581_1__hypothetical_protein_MIV009R_[Invertebrate_iridescent_virus_3] 16 1140 1140 BrMar_R45 5 1239 1240 2E-087 303 1312

Acontece que são vários Hits de Blast, e tenho que associar o número que aparece depois de "gi" a outro numero que consta em uma lista em outro arquivo:

Ex:
109287882 NCVOG0001
109287887 NCVOG0002

Eu poderia apenas inserir no output file do linux ou no input file antes de rodar o Blast!! Mas não sei fazer essa alteração. Alguma dica??




  






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