Baixar e instalar - Diferenças em relação ao Windows

1) Como faço para escolher uma pasta onde todos os programas que eu baixe no Ubuntu 9.04 Desktop sejam armazenados?

Obs.: Explique da forma mais clara e detalhada possível, por favor.

2) De que forma esses programas (é este o nome no Linux?) são baixados? apenas através do navegador ou também através de comandos apropriados após chamar o terminal para digitá-los?

Obs.: Idem a obs. da primeira questão.

3) Após terem sido baixados em uma pasta específica, de que forma devo proceder (explique passo a passo, por favor) para instalar o programa baixado?

4) Quais as principais diferenças entre o Linux e o Windows em termos de baixar e instalar programas?

5) Existe a necessidade de instalar um limpador de registros no Linux tal qual no Windows para eliminar registros? (tais quais o CCleaner e RegCleaner)

Amigo...
Hoje em dia o Linux não está tão difícil de instalar pacotes (equivalente a .exe no windows),
1- Para baixar seus programas você pode criar uma pasta em um d iretório, aconselhável o home do usuário (/home/usuário). Em todas as distros linux existem os gerenciadores de pacotes, nos quais você instala os pacotes através da console digitando,
2- No caso do Ubuntu apt-get (o mais usado, pelo menos no meu ponto de vista), tratando-se do apt-get, ele faz tudo sozinho, procura por dependências e instala os pacotes sem intervenção do usuário, a sintaxe é simples apt-get install openldap, por exemplo.
3- No linux você pode baixar pacotes tar ou rpm, o rpm é muito simples para instalar :
rpm -ivh pacote.rpm e o tar também não é muito diferente: tar -xvzf pacote.tar.gz ou ..tar.
Neste caso o linux não consegue tratar as dependências, aí o usuário deveria intervir instalando as dependências manualmente através do rpm ou procurando os pacotes na Internet.
4- A principal diferença é que no windows você executa o .exe e não faz mais nada do que clicar em next, netx, next,..., finish.
5- No meu ponto de vista não tem necessidades, porque tudo no linux é arquivo de configuração, simplesmente tudo.

Espero ter esclarecido um pouco sua dúvida..
Abraços