Esse código gera seis números aleatórios e distintos (diferentes, não repetidos) usando o módulo random. Procurei comentar da melhor forma possível para ficar bem didático...

Espero que seja útil.

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#!/usr/bin/python3
#-*- coding: utf-8 -*-
#Gerador de palpites para jogos da Megasena com 6 digitos
#Marcio Luís Siqueira 24/03/2104



import random #importa modulo random

lista_palpite = [] #cria lista de palpites
contador = 0 # cria um contador

while contador < 6:
    palpite = random.randint(1, 60)
    if palpite not in lista_palpite:
        contador += 1
        lista_palpite.append(palpite)
    else: pass

lista_palpite.sort()

print('{},{},{},{},{},{}'.format(lista_palpite[0], lista_palpite[1],
    lista_palpite[2], lista_palpite[3], lista_palpite[4], lista_palpite[5]))

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