Download do banco de dados NCBI NR (DNA) [Shell Script]

Download do banco de dados NCBI NR (DNA)

Publicado por José Cleydson Ferreira da Silva (última atualização em 22/11/2010)

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Homepage: geminivirus.org

Download downNcbiNr

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Esse script faz o download do banco de dados do NCBI (Amino Ácido). Esse banco possui todos os dados referentes a DNA de diversas espécies que já foram decifradas e que estão disponibilizadas para a comunidade cientifica de todo o mundo.

Esconder código-fonte

#!/bin/sh

# Script para download dobanco de dados  ncbi Nr (Amino Ácido)
# 04/10/2010 - Cleysinho
# cleysinhonv@gmail.com - twitter @jcleydsonf
# Versão 0.1.1
# Observações:
# O processo de download das bases de dados do banco de dados pode ser demorado.


echo 'Iniciando Download 00' > status_download_nr
wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nr.00.tar.gz

echo 'Iniciando Download 01' >> status_download_nr
wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nr.01.tar.gz

echo 'Iniciando Download 02' >> status_download_nr
wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nr.02.tar.gz

echo 'Iniciando Download 03' >> status_download_nr

wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nr.03.tar.gz

echo 'Iniciando Download 04' >> status_download_nr
wget ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nr.04.tar.gz

echo 'Terminado Download'  >> status_download

# Fim do script

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Comentários

[1] Comentário enviado por FERNANDORSN em 15/07/2014 - 14:07h

Como Consigo uma base de dados para banco de dados não relacional (NoSql)Mongodb com grande volume e variabilidade dos dados?
Valeu!

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