Alguns usuários costumam usar um arquivo de configuração para configurar o xterm e o rxvt, o .Xdefault ou o .Xresources, um desses dois. Para aplicar as configurações imediatamente para esses programas é usado esse comando no terminal ou até pode ser inserido no bashrc:

xrdb -merge ~/.Xresources

E assim as configurações são aplicadas. Mas, você pode querer modificar uma configuração para esses programas e ao aplicar esse comando, você percebe que as configurações não foram alteradas. Isso porque esse comando só vai aplicar os comandos adicionados e não os que já estão configurados.

Então, para resolver esse problema, você pode resetar as configurações do .Xresources com esse comando:

xrdb -remove

Com isso, ao aplicar as configurações novamente, as configurações serão aplicadas corretamente.