O Windows é setado, por padrão, como "30_os_prober" no arquivo "/etc/grub.d", então renomeie (ou use o comando mover) para "09_os_prober", já que o Linux é setado a partir do 10.

sudo mv -i 30_os-prober 09_os-prober

Depois execute:

sudo update-grub

Pronto! O seu Winows estará iniciando por padrão.