Ao iniciar o Linux, uma série de processos são iniciados pelo init, entre eles vários scripts dentro do diretório /etc/init.d.

Esses scripts na verdade são executados pelo /etc/init.d/rc, é como se o processo init executasse:

# /etc/init.d/rc "runlevel"

Sendo que o runlevel é aquele mesmo indicado no inittab, tendo como exemplo o "runlevel" 3, o rc irá iniciar apenas os serviços que estejam no campo on-levels do runlevel.conf que possua o nível 3 marcado.

Com isso, se eu quiser que um serviço seja ou não iniciado, basta eu editar o terceiro campo com os níveis de execução desejado, lembrando que no Debian o padrão é o runlevel 2.

Apesar do campo sort, os primeiros scripts a serem executados são os marcados com S, que sempre são inicializados independente do runlevel, em seguida na ordem que aparecem no arquivo runlevel.conf. Então se eu quiser que Z seja executado primeiro, tenho que colocá-lo numa linha antes que o X.