configuração não ficando salva

Olá boa tarde,
estou com um problema em meu servidor linux com CentOS release 6.9
todo procedimento que faço nele as configurações voltam, por exemplo.
Faço uma configuração no iptables, a mesma fica ativa passa alguns minutos as regras deixam de ser validas mas ainda ficam no arquivo /etc/sysconfig/iptables.
Isso também acontece com outras coisas como o comando shopt -s extglob
Alguém faz ideia do que seja?

Deixa eu adivinhar, você está fazendo as configurações na sessão do emulador de terminal ativa e elas deixam de valer quando você fecha o emulador de terminal, né?
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Dino®
Vi veri universum vivus vici
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Só Slackware é GNU/Linux e Patrick Volkerding é o seu Profeta

Mensagem do dia: Satã representa conhecimento sem limites e não auto-ilusão hipócrita. 

Isso é direto no servidor, e sem perder a sessão. E mesmo que eu abra o screen(para não sair da sessão) passa alguns minutos a configuração deixa de ser valida.

Beleza, então isso muda o cenário. Como você está estabelecendo as configurações que não permanecem?

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Por exemplo estou no servidor ai vou la e faço o seguinte procedimento.
########################
/etc/init.d/iptables stop

/sbin/iptables -F
/sbin/iptables -t nat -F
/sbin/iptables -X

/sbin/iptables -A OUTPUT -p tcp --dport 25 -j DROP

/etc/init.d/iptables save

/etc/init.d/iptables start
########################

Sem perder a sessão no ssh, passa alguns minutos simplesmente quando dou o comando iptables -L retorna que não tem nenhuma regra ativa, porém no arquivo /etc/sysconfig/iptables no qual guarda as regras, mostra que elas estão la, ou seja as regras são "resetadas" porém ficam no arquivo de configuração e o iptables mesmo startado não consegue ler e retorna como se não tivesse regra.

Isso também para outros procedimentos como o comando shopt -s extglob, passa algum tempo quando vou remover arquivos com exceção, da erro como se eu não tivesse "instalado o plugin shopt -s extglob".

Tem ideia do que pode ser?

Me tira uma dúvida: o CentOS 6.9 não usa o systemd não?
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Dino®
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Somente a partir da versão 7.0 que utiliza systemd
Por exemplo estou no servidor ai vou la e faço o seguinte procedimento.
########################
/etc/init.d/iptables stop

/sbin/iptables -F
/sbin/iptables -t nat -F
/sbin/iptables -X

/sbin/iptables -A OUTPUT -p tcp --dport 25 -j DROP

/etc/init.d/iptables save

/etc/init.d/iptables start
########################

Sem perder a sessão no ssh, passa alguns minutos simplesmente quando dou o comando iptables -L retorna que não tem nenhuma regra ativa, porém no arquivo /etc/sysconfig/iptables no qual guarda as regras, mostra que elas estão la, ou seja as regras são "resetadas" porém ficam no arquivo de configuração e o iptables mesmo startado não consegue ler e retorna como se não tivesse regra.

Isso também para outros procedimentos como o comando shopt -s extglob, passa algum tempo quando vou remover arquivos com exceção, da erro como se eu não tivesse "instalado o plugin shopt -s extglob".

Tem ideia do que pode ser?