Ajuda - dúvida de como instalar o Mummer

JuKupper
(usa Ubuntu)

Enviado em 24/03/2021 - 17:07h

Prezad@s. Boa tarde. Meu nome é Juliana Morini. Eu não entendo nada de Linux. Comecei a fazer uma disciplina vinculada ao programa de doutorado em Bioinformática da USP/SP. Eu preciso muito instalar vários programas para fazer anotação de genoma. Eu dou os seguintes comandos:

root@Juliana-VirtualBox: /home/juliana# sudo apt-get update
Lendo listas de pacotes...Pronto
root@Juliana-VirtualBox: /home/juliana# sudo apt-get install mummer
Lendo listas de pacotes...Pronto
Construindo árvore de dependências
Lendo informação de estado...Pronto
E: Impossível encontrar o pacote mummer
root@Juliana-VirtualBox: /home/juliana#



Sabem me dizer o que devo fazer?
Agradeço pela atenção

SamL
(usa XUbuntu)

Enviado em 24/03/2021 - 17:50h

Ele não instala porque não está disponível em nenhum repositório da sua distro. Acredito que você deva ir no site do mummer e baixar o source e compilar ele.
Aqui o site dele:
https://mummer4.github.io/

Siga o manual de instalação que tem no site.

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https://nerdki.blogspot.com/ acessa aí vai lá, é grátis!
Capeta (demo) do meu trabalho:
https://github.com/cpusam
"com o bug fix vem a perfeição"

leandropscardua
(usa Ubuntu)

Enviado em 24/03/2021 - 19:05h

veja se o pacote está disponível
apt-cache search mummer
Ao que parece estava disponível no ubuntu 18.04, mas certo mesmo é compilar pelo código fonte. Vc pode baixar o fonte pelo site e usar o auto-apt p resolver algumas dependências
https://sempreupdate.com.br/conheca-o-auto-apt-e-facilite-suas-instalacoes-compilacoes/