Primeiro você deve tentar pelo comando no bash mouseconfig, que é mais simples, onde se escolhe o mouse e pronto. Se ele não funcionar e ficar correndo pra o canto da tela e travar lá, aí você vai fazer o seguinte.

Entre em /etc/X11, edite o arquivo xorg.conf e depois procure as seguintes linhas:

#Identifier and driver
Identifier "Mouse1"
Drive "mouse"

Logo abaixo tem uma linha assim:

Option "protocol" "auto"

O que você vai fazer é mudar esse "auto" para "Microsoft", ficando assim:

E logo abaixo tem mais 2 opções, uma PS/2 e outra XQUEUE, mude elas também, deixando exatamente como a primeira:

Feito isso e só entrar no X novamente e conferir se está correto. O meu ficou ótimo.