Certa vez, mexendo nos diretórios do Mozilla Firefox, encontrei um arquivo chamado bookmarks.html e não é que lá estavam todos os meus favoritos (incluindo os da barra de favoritos). Percebi que o Firefox armazena todos os seus favoritos neste arquivo. Se quiser então fazer backup dos seus favoritos, é só salvar esse arquivo.

Outra coisa interessante que dá para fazer, caso tenha o Windows ou outro sistema instalado na mesma máquina é compartilhar os favoritos. É só criar um link desse bookmarks.html.

Por exemplo:

$ ln -s "/mnt/windows/Documents and Settings/[meuusuario]/Dados de Aplicativos/Mozilla Firefox/Profiles/[meuprofile]/bookmarks.html" /home/[meuusuario]/.mozilla/[meuprofile]/bookmarks.html

(tudo na mesma linha)

Lembrando que se o sistema de arquivos do seu Windows for NTFS você Não irá conseguir gravar os favoritos. E substitua [meuusuario] e [meuprofile] pelos seus respectivos correspondentes. O [meuprofile] geralmente é um nome estranho com a extensão .default.

É isso ae.