System Error Apport é um mecanismo do Ubuntu para que os usuários possam reportar os erros do sistema facilmente. Porém se você nunca reporta os erros, fica irritado com essas mensagens que na maioria das vezes não afeta o funcionamento do seu sistema e não deseja mais receber essas mensagens de erro, abra um terminal e rode o comando abaixo para remover o pacote Error Apport:

sudo apt-get remove apport apport-symptoms

Caso você mude de ideia e decida reportar os bugs, basta reinstalar programa com o comando:

sudo apt-get install apport apport-gtk apport-symptoms