Após a instalação da interface gráfica no CentOS, toda vez que ligava o computador perdia as configurações de DNS, mesmo informando no ifcfg-eth0 que não queria DNS automático (PEERDNS="no").

A solução, foi desabilitar o NM (NetworkManager) que acompanha a interface gráfica.

Para isso, precisamos removê-lo da inicialização e recolocarmos o Network no seu lugar com os comandos:

# service NetworkManager stop
# chkconfig NetworkManager off
# chkconfig network on
# service network start
# chkconfig --list


Referência: Mosaic Data Services - Disable Network Manager in CentOS 6