Partindo do princípio que o website esteja armazenado no diretório /var/www/public_html/meusite e que o diretório de uploads seja /var/www/public_html/meusite/uploads, basta criar um arquivo ".htaccess" (com ponto no início) com o seguinte conteúdo:
vim /var/www/public_html/meusite/uploads/.htaccess
php_flag engine off
<Files ~ "\.html$">
deny from all
</Files>
E pronto! O diretório uploads e todos os seus subdiretórios estarão protegidos.
php_flag engine off - previne que o servidor execute arquivos PHP. Neste caso eles serão tratados como arquivo texto.
<Files ~ "\.html$">
deny from all
</Files>
O bloco acima previne que crackers pratiquem deface, subindo páginas HTML maliciosas. As páginas HTML também serão tratadas como arquivo texto.
Obviamente, não dê permissão de escrita ao .htaccess. Muita gente tem mania de dar permissão total (chmod 777) em diretórios de upload, neste caso não adiantaria nada, pois o cracker poderia sobrescrever o .htaccess. Só que isso já é papo para outra dica.
[1] Comentário enviado por MaisSecurity em 08/01/2016 - 14:33h
Muito bom parabéns, isso dará um vídeo em meu canal =D eu fiz um vídeo ensinando como invadir o site com backdoor, agora vou mostrar como se proteger do ataque =D