Dica testada no Gnome-shell 3.16 com a distribuição Debian Sid.

O Gnome-shell possui efeitos, animações discretas. O tempo padrão dessas animações é definido como fator 1. Caso o usuário queira deixar as animações mais lentas, pode alterar esse fator.

Primeiro pressione ALT+F2, digite o comando "lg" (sem aspas) e depois Enter para habilitar o Looking Glass.

Na janela que aparecer, na aba Evaluator, digite ou cole o comando:

St.set_slow_down_factor(2)

Troque o 2 por outro número se quiser. Lembrando que eu gostei do 2, achei o 10 extremamente lento. Pressione Enter, Esc e depois a tecla Super (Windows Key) para ver a velocidade da animação.

Para desabilitar animações, use fator 0. E para deixar normal, use fator 1.

Também é possível desabilitar as animações pelas configurações do Gnome em Gnome Tweak Tool.

Fonte:

• https://wiki.gnome.org/Projects/GnomeShell/LookingGlass